Metodat dhe mjetet e hapura

In addition to data sharing, the openness of research relies on sharing of materials.

Reagjensët

Reagjensi është një substancë, përbërje ose përzierje që mund të shtohet në një sistem në mënyrë që të krijojë një reaksion kimik ose reaksion tjetër. Reagjensët mund të depozitohen në repozitorium si Addgene, The Bloomington Drosophila Stock Center dhe ATCC për t’i bërë ato lehtësisht të arritshme për studiuesit e tjerë. Licenconi materialet tuaja në mënyrë që ato të mund të ripërdoren nga studiues të tjerë.

Protokollet

Një protokoll përshkruan një rekord zyrtar ose zyrtar të vëzhgimeve shkencore eksperimentale në një format të strukturuar. Depozitoni protokollet virtuale për citim, përshtatje dhe ripërdorim duke përdorur Protocols.io.

Fletore, kontejnerë, softuer dhe harduer

Ndarja e softuerit të përdorur për hulumtim (qoftë me natyrë kompjuterike, apo që mbështetet në ndonjë analizë / interpretim të bazuar në softuer) është një kusht i domosdoshëm, megjithëse jo i mjaftueshëm, për riprodhueshmëri.

Analiza e riprodhueshme ndihmohet nga përdorimi i programimit të literaturave, teknologjisë së kontejnerëve dhe virtualizimit.

Të kesh softuer kërkimor në GitHub është vetëm pjesa e parë; është po aq e rëndësishme të kesh një identifikues të botuar dhe persistent të lidhur me të, siç është një DOI.

Përveç ndarjes së kodit dhe të dhënave tuaja, gjithashtu ndani Jupyter notebooks tuaja, Docker images, ose materiale të tjera analize ose varësi të softuerit. Ndani fletoret me Open services si mybinder që lejojnë shikimin dhe zbatimin publik të të gjitha fletoreve në burimet e përbashkëta. Kontejnerët dhe fletoret mund të ndahen me Rocker ose Code Ocean.

Protokollet vetëm për lexim duhet të depozitohen në regjistrin tuaj të disiplinave të tilla si ClinicalTrials.gov dhe Regjistri i Shkencave Sociale ose një regjistër i përgjithshëm si Kuadri i Hapur Shkencor. Shumë revista, të tilla si Provat, Protokollet e Kërkimit JMIR ose Bio-Protokolli, do ta botojnë protokollin tuaj.

Burim i hapur softuer

Softueri i ndarë publikisht nuk është në të vërtetë burim i hapur nëse nuk shoqërohet nga një licencë e përshtatshme, sepse nga programi i paracaktuar (së bashku me çdo vepër tjetër krijuese) bie nën të drejtën ekskluzive të autorit për krijuesit, që do të thotë se askush tjetër nuk mund ta përdorë, kopjojë, shpërndajë ose modifikojë punën tuaj(choosealicense.com).

Në vend të kësaj, ju duhet të zgjidhni një licencë të përshtatshme për softuerin tuaj, bazuar në atë që preferoni të lini të bëjnë të tjerët (ose t’i parandaloni të bëjnë) me kodin tuaj.

Faqja choosealicense.org  është një burim i dobishëm për të bërë dallimin midis licencave, megjithëse nuk përmban çdo licencë të burimit të hapur të disponueshëm ose të njohur. Sapo të zgjidhni një licencë, vendosni tekstin – të redaktuar për të përfshirë emrin e autorit dhe vitin – në repozitoriumin e softuerit si një skedar LICENCË me tekst të thjeshtë.

Edhe pse ndarja e softuerit në çdo formë është më e mirë sesa mosndarja e tij, softueri juaj do të ketë më shumë ndikim dhe do të përdoret më lehtë nga të tjerët – dhe nga ju në të ardhmen! – nëse përfshini dokumentacionin. Kjo mund të përfshijë komente të dobishme në kod që shpjegojnë pse keni bërë diçka (në vend të asaj që keni bërë, e cila duhet të jetë e qartë), një skedar informues MË LEXO që përshkruan atë që bën softueri juaj dhe jep disa informacione të dobishme (p.sh., si të instaloni, si të citoni, si të drejtoni, të rëndësishme), udhëzime / shembuj dhe / ose dokumentacionin API (i cili mund të gjenerohet automatikisht nga komentet e formatuara siç duhet në kod).

Varësitë e munguara ose të paarritshme ose dokumentacioni i pamjaftueshëm i mjedisit llogaritës janë pengesa shumë të zakonshme për ripërdorimin dhe riprodhueshmërinë. Një qasje për të adresuar këto pengesa është të ndani kodin tuaj me mjedisin tuaj kompjuterik duke përdorur teknologjinë e kontejnerëve.

Licencë e hapur dhe PËRMASAT E SKEDARËVE 

Licenca është një dokument ligjor që i jep të drejta specifike përdoruesit për të ripërdorur dhe rishpërndarë një material me disa kushte. Çdo e drejtë që nuk jepet si parazgjedhje nga licencuesi përmes licencës mund të kërkohet. Licencat mund të aplikohen për çdo material (p.sh., tingulli, teksti, imazhi, multimedia, softueri) ku ekzistojnë disa të drejta shfrytëzimi ose përdorimi.

Licencat e përmbajtjes falas janë licenca që japin leje për të hyrë, ripërdorur dhe rishpërndarë materialin me pak ose aspak kufizime. Këto licenca variojnë nga shumë të hapura deri te ato shumë të kufizuara. Sa më shumë kufizime, aq më i vështirë bëhet kombinimi i ndryshëm i përmbajtjes së licencave – duke parandaluar kështu potencialisht ndërveprimin.

Një format skedari është një mënyrë standarde që informacioni është i koduar për ruajtje në një skedar kompjuteri; megjithatë, jo të gjitha formatet kanë dokumente specifike të disponueshme, pjesërisht, sepse disa zhvillues/krijues i shohin dokumentet e tyre të specifikimit si sekrete tregtare.

Licencat më të përdorura për përmbajtjen shkencore janë licencat Creative Commons (e përbashkëta creative). Në përgjithësi, një licencë CC BY (që kërkon vetëm atribuim) është një mundësi e mirë për vepra të tilla si artikuj, libra, punime dhe raporte ndërsa rekomandohet një dedikim për domenin publik duke përdorur CC Zero (CC0) për të dhënat dhe bazat e të dhënave.

Brenda kontekstit të shkencës së hapur, dhe për arkivimin optimal afatgjatë, skedarët nuk duhet të jenë të ngjeshur dhe duhet të shmangin pronësinë ose formatet e ngarkuara me patentë dhe në favor të formateve të hapura bazuar në standardet e dokumentuara. Kjo siguron aksesin dhe ripërdorshmërinë e përmbajtjes. Vetëm skedarët e joenkriptuar duhet të publikohen dhe arkivohen.